По Эстонии можно перемещаться на машинах, велосипедах, поездах (в том числе пригородных), автобусах.
Если говорить про дальние точки маршрутов, то это Таллинн и Тарту. Однако и по дороге можно встретить много чего интересного.
В первую очередь заслуживает внимание берег залива. Во многих местах он очень красив, периодически встречаются обзорные виды как, например, в Тойло (водопад Валасте, скалы Онтика).
Но, конечно, первым делом Вы попадаете в Нарву (если движетесь не через Псков). Нарва сама по себе уже интересна своим замком и набережной. Можно также съездить в Усть-Нарву (Нарва-Йыэсуу).
Из более дальних точке заслуживает интерес Раквере.
Если Вы едите на велосипеде, обратите внимание на возможность часть пути (например обратно) преодолеть на пригородном поезде.